Ide penelitian ini peneliti dapatkan berdasarkan pengalaman posisi peneliti menjadi koordinator kebersihan dan kesehatan Pondok Pesantren Annur. Bahwa kebersihan Pondok Pesantren identik dengan hidup kumuh dan kotor dan kesehatanpun juga banyak yang sakit kulit. Penelitian ini mengungkapkan apakah Kebersihan Lingkungan memiliki pengaruh terhadap Kesehatan Fisik para Santri di Pondok Pesantren Annur. Adapun rumusan masalahnya adalah bagaimana kebersihan lingkungan dan kesehatan fisik para santri di Pondok Pesantren An Nur. Seberapa besar pengaruh kebersihan lingkungan terhadap kesehatan fisik para santri di Pondok Pesantren An Nur Ngrukem Pendowoharjo Sewon Bantul. Penelitian ini menggunakan metode kuantitatif dan juga menggunakan metode kualitatif sebagai data pendukung dengan dua variabel yakni variabel X= Kebersihan Lingkungan, Y= Kesehatan Fisik. Lokasi penelitian ini adalah di Pondok Pesantren Annur Ngrukem Pendowoharjo Sewon Bantul Yogyakarta. Obyek penelitian adalah santri Pondok Pesantren Annur sehingga jumlah populasi 1023 jadi sampelnya adalah 102 santri. Pengumpulan data yang dilakukan dengan menggunakan angket dan untuk memperkuat analisis dengan menggunakan observasi, wawancara dan dokumnetasi. Analisis instrument meliputi analisis validitas dan reliabilitas. Hasil analisis menunjukan valid dalam variabel kebersihan lingkungan 18 item yang tidak valid 2 dan variabel kesehatan fisik yang menunjukan valid 19 item dan yang tidak valid 1. Kondisi kebersihan lingkungan bisa disimpulkan Pondok Pesantren An Nur cukup bersih dari segi kebersihan tempat wudlu, kamar mandi, kamar tidur, mushola, Aula, halaman dan lain sebagainya dari pada tahun sebelumnya. Meskipun tidak banyak, masih dijumpai sampah di beberapa sudut kamar. Akan tetapi dari pengurus pondok Departemen Kebersihan dan Kesehatan sendiri selalu memaksimalkan kinerjanya dalam rangka menjaga kebersihan lingkungan tersebut. Dan mengenai kesehatan fisik santri juga meningkat. Karena santri Pondok Pesantren An Nur jarang sakit. Hal ini dapat dilihat dari mulai berkurangnya penyakit kulit dan penyakit-penyakit yang lain. Berdasarkan analisis data yang peneliti lakukan menggunakan asumsi korelasi, hasil penelitian diperoleh bahwa secara parsial Kebersihan lingkungan memiliki pengaruh terhadap Kesehatan Fisik para santri di Pondok Pesantren Annur Ngrukem Pendowoharjo Sewon Bantul diperoleh t hitung = 1,58% berada di daerah penerimaan hipotesis. Kebersihan Lingkungan terhadap Kesehatan Fisik Santri Annur berkorelasi positif dan signifikan sebesar 1,58. Hal ini membuktikan hubungan korelasi sangat lemah. Dengan demikian hepotesis di terima.