Perkembangan teknologi informasi saat ini tumbuh dengan sangat cepat. Teknologi di bidang pendidikan mendorong pemanfaatan Sistem Informasi Akademik (SIA). DeLone dan McLean(2003) mengatakan SIA sebagai sarana untuk meningkatkan efisiensi layanan akademik. Dari hasil pra-survei, terdapat fenomena ganguan sistem, kesulitan pengisian KRS, prosedur login yang membinggungkan dan tampilan halaman SIA yang kurang informatif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh Kualitas Sistem dan Informasi Terhadap Kepuasan Pengguna Sistem Informasi Akademik (SIA). Penelitian ini menggunakan metode kuantitatif, yang terdiri dari tiga variabel Kualitas Sistem (X1), Kualitas Informasi (X2), dan Kepuasan Pengguna (Y). Analisis data menggunakan regresi linier berganda, sampel penelitian ini berjumlah 276 responden yang ditentukan menggunakan teknik simple random sampling diperoleh dari seluruh Mahasiswa Institut Ilmu Al-Qur’an An Nur Yogyakarta dan data diolah menggunakan SPSS versi 23. Hasil regresi linier berganda menunjukkan kualitas sistem (X1) berpengaruh secara parsial terhadap kepuasan pengguna SIA (Y) dengan nilai signifikan sebesar 0,000 < 0,05 dan T hitung (6,392) < t tabel (1,998). Kualitas informasi (X2) berpengaruh secara parsial terhadap kepuasan pengguna SIA (Y), dibuktikan dengan hasil nilai signifikan sebesar 0,000 < 0,05 dan nilai T hitung (10,381) > t tabel (1,998). Serta hasil uji koefisien determinasi sebesar 0,598 menunjukkan bahwa kualitas sistem dan informasi mempu menjelaskan variabel kepuasan pengguna sebesar 58,9% sedangkan sisanya 41,1% dijelaskan oleh oleh variabel lain di luar penelitian.