Hasil belajar Pendidikan Agama Islam dipengaruhi oleh beberapa faktor, di antaranya kecerdasan emosional dan kecerdasan spiritual. Kecerdasan emosional berperan dalam membantu siswa mengelola emosi selama proses pembelajaran, sedangkan kecerdasan spiritual mendorong siswa untuk memahami dan menghayati nilai-nilai agama dalam kehidupan sehari-hari. Melihat fakta tersebut, maka peneliti ingin mengetahui pengaruh kecerdasan emosional dan kecerdasan spiritual terhadap hasil belajar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui: (1) Adakah hubungan yang positif dan signifikan antara kecerdasan emosional dan hasil belajar Pendidikan Agama Islam pada siswa Kelas Khusus Olahraga di SMA Negeri 1 Sewon Bantul Yogyakarta. (2). Adakah hubungan yang positif dan signifikan antara kecerdasan spiritual dan hasil belajar Pendidikan Agama Islam kurikulum merdeka pada siswa Kelas Khusus Olahraga di SMA Negeri 1 Sewon Bantul Yogyakarta, dan (3) Seberapa besar pengaruh antara kecerdasan emosional dan kecerdasan spiritual terhadap hasil belajar Pendidikan Agama Islam siswa Kelas Khusus Olahraga di SMA Negeri 1 Sewon Bantul Yogyakarta. Penelitian ini menggunakan metode kuantitatif dengan desain non-eksperimen yang melibatkan 3 variabel yakni kecerdasan emosional (X1), kecerdasan spiritual (X2), dan hasil belajar (Y). Subjek penelitian adalah siswa Kelas Khusus Olahraga (KKO) dengan jumlah responden 105 siswa. Pengumpulan data menggunakan metode kuesioner dan dokumentasi. Analisis instrumen validitas isi dilakukan menggunakan rumus Aiken, sedangkan analisis instrumen reliabilitas menggunakan Cronbach Alpha. Kemudian, analisis data dilakukan dengan analisis regresi ganda. Berdasarkan analisis yang dilakukan dengan menggunakan uji regresi ganda, diperoleh kesimpulan bahwa: (1) Ada hubungan yang positif dan signifikan antara variabel kecerdasan emosional (X1) dengan variabel hasil belajar (Y). Hal tersebut ditunjukkan dengan nilai korelasi (r) sebesar 0,278 dan p (sig) 0,004 dalam kategori rendah. (2) Ada hubungan yang positif dan signifikan antara kecerdasan spiritual (X2) dengan hasil belajar (Y). Hal tersebut ditunjukkan dengan nilai korelasi (r) sebesar 0,288 dan p (sig) 0,002 dalam kategori rendah. (3) Secara bersama-sama variabel kecerdasan emosional (X1) dan kecerdasan spiritual (X2) mempengaruhi hasil belajar PAI (Y) sebesar 8,5% . Adapun sisanya, yaitu 91,5% (100%-8,5%) hasil belajar PAI dipengaruhi oleh variabel lain diluar penelitian ini.